De geschiedenis van de uitgeverij gaat terug tot 1836, toen de uitgeverij werd gesticht door Jan Brendts Wolters die een boek- en papierwinkel in Groningen had. Het bekendste product van de uitgeverij, de Bosatlas, wordt sinds 1877 uitgegeven. In 1968 fuseerde Wolters met de eveneens Groningse uitgever Noordhoff tot Wolters-Noordhoff, waarna de onderneming uiteindelijk in 1987 onderdeel werd van Wolters Kluwer.
Bij de verkoop van de educatieve tak in 2007 besloot dat bedrijf de naam Wolters voor zichzelf te reserveren en werd de naam van de uitgever van lesmaterialen veranderd in Noordhoff Uitgevers.