Hoogstrate ging in therapie en kwam zijn problemen te boven. Gedurende zijn contract in Brabant werd Hoogstrate verhuurd aan Emmen en daar liep hij tot twee keer toe tegen een zware knieblessure aan. In beide gevallen ging het om een gescheurde kruisband. Inmiddels is Hoogstrate volledig fit verklaard door de artsen van het UMCG en loopt de speler, die op 18 maart 2001 zijn debuut maakte in een uitwedstrijd tegen NEC, al een aantal maanden mee als assistent-trainer van FC Groningen B1.
Recent had Hoogstrate al te kennen gegeven om als trainer aan de slag te gaan en was begonnen met trainerscursussen. Op de website van FC Groningen laat Hoogstrate weten blij te zijn. “Ik heb ongelooflijk veel zin om weer wedstrijden te spelen. Ik train sinds een tijdje weer mee met de selectie van Jong FC Groningen. Ik ben voor negentig procent wedstrijdfit. Ik vind het fantastisch dat FC Groningen me deze kans biedt. Ik zie dit weer als een volgende stap. We zullen wel zien waartoe het leidt.”
Jordi Hoogstrate speelde tot nu toe 52 wedstrijden voor FC Groningen. De laatste was op 5 april 2003 toen in Arnhem met 0-0 gelijkgespeeld werd tegen Vitesse.
